Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP2P08253 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP2P08253 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP2P08253 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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