Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP104O60308 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP104O60308 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms