Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN9O14815 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN9O14815 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN9O14815 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN9O14815 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN9O14815 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN9O14815 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN9O14815 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN9O14815 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN9O14815 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN9O14815 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN9O14815 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN9O14815 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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