Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XIRP2A4UGR9 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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