Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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USP15Q9Y4E8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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USP15Q9Y4E8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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USP15Q9Y4E8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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USP15Q9Y4E8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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USP15Q9Y4E8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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USP15Q9Y4E8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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