Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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HDGFL3Q9Y3E1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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HDGFL3Q9Y3E1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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