Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF24Q9UPV7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms