Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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COPS7AQ9UBW8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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COPS7AQ9UBW8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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