Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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