Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms