Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms