Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 GRID1-201ENST00000327946 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP8Q9BV40 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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