Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms