Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms