Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

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Length 1,954 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CHD5Q8TDI0 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CHD5Q8TDI0 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CHD5Q8TDI0 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHD5Q8TDI0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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