Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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