Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms