Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00242Q5T6M2 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms