Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms