Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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