Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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NCOA1Q15788 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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