Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ARRB2-219ENST00000576235 991 ntTSL 515.87■□□□□ 0.136e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.116e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.16e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.086e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.016e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 LUC7L3-217ENST00000510984 505 ntTSL 314.89□□□□□ -0.036e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.056e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.076e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.076e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.096e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 ARRB2-213ENST00000573886 665 ntTSL 214.38□□□□□ -0.116e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.126e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 GREB1-209ENST00000472040 571 ntTSL 514.26□□□□□ -0.136e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.136e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.136e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SCAMP3-208ENST00000490999 1011 ntTSL 214.18□□□□□ -0.145e-11■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 LUC7L3-212ENST00000508045 1112 ntTSL 1 (best)14.07□□□□□ -0.166e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.176e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SDK1-203ENST00000426596 554 ntTSL 213.62□□□□□ -0.236e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.236e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.266e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 LUC7L3-206ENST00000504563 840 ntTSL 513.43□□□□□ -0.266e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 DNM2-222ENST00000593220 561 ntTSL 313.26□□□□□ -0.296e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-8■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.36e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.356e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 DMWD-203ENST00000537879 843 ntTSL 1 (best)12.78□□□□□ -0.365e-11■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.376e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 CPNE2-208ENST00000566910 938 ntTSL 512.45□□□□□ -0.426e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.426e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 LUC7L3-207ENST00000505619 658 ntTSL 312.39□□□□□ -0.436e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 LUC7L3-214ENST00000508482 1597 ntTSL 212.3□□□□□ -0.446e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 LUC7L3-213ENST00000508218 533 ntTSL 212.25□□□□□ -0.456e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.455e-11■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 CPNE2-205ENST00000565951 2291 ntTSL 212.23□□□□□ -0.456e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.476e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.496e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 LUC7L3-215ENST00000509335 582 ntTSL 211.81□□□□□ -0.526e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.556e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.64e-7■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 MAP3K9-204ENST00000554146 2982 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.626e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 TRIM26-268ENST00000454678 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-8■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SCAMP3-203ENST00000462151 819 ntTSL 510.99□□□□□ -0.655e-11■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 AMBRA1-207ENST00000529553 586 ntTSL 310.88□□□□□ -0.676e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.676e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.696e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.76e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 ADD1-221ENST00000536078 423 ntTSL 210.62□□□□□ -0.716e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.716e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 POGZ-219ENST00000533351 586 ntTSL 510.58□□□□□ -0.726e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 TRIM26-266ENST00000437089 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.732e-8■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 POGZ-209ENST00000467287 649 ntTSL 410.28□□□□□ -0.766e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 PIP5K1B-205ENST00000472907 731 ntTSL 310.14□□□□□ -0.796e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 CPNE2-206ENST00000566042 3446 ntTSL 210.04□□□□□ -0.86e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SMARCA1-205ENST00000617310 4291 ntTSL 29.99□□□□□ -0.814e-7■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.836e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 KIF1B-205ENST00000377093 7565 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.836e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 ARRB2-208ENST00000571428 864 ntTSL 39.83□□□□□ -0.846e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 MAP3K9-202ENST00000553414 3544 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.856e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.916e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 EIF3D-204ENST00000426531 710 ntTSL 29.23□□□□□ -0.936e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.956e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.966e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.964e-7■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SEPT6-207ENST00000467310 1061 ntTSL 38.75□□□□□ -1.016e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.064e-7■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.076e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 EIF3D-208ENST00000458572 883 ntTSL 38.24□□□□□ -1.096e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 AVL9-203ENST00000446718 6372 ntTSL 57.81□□□□□ -1.166e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 AP3B1-202ENST00000517561 498 ntTSL 57.15□□□□□ -1.266e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 POGZ-210ENST00000476128 397 ntTSL 57.14□□□□□ -1.276e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.286e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 PIP5K1B-202ENST00000377284 612 ntTSL 36.91□□□□□ -1.36e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 FAM168A-203ENST00000432223 696 ntTSL 36.67□□□□□ -1.346e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 KIF1B-209ENST00000495136 643 ntTSL 36.33□□□□□ -1.46e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 AVL9-208ENST00000497020 677 ntTSL 56.24□□□□□ -1.416e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 LUC7L3-221ENST00000513025 594 ntTSL 36.15□□□□□ -1.426e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.456e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 PIP5K1B-207ENST00000478500 3335 ntTSL 1 (best)5.86□□□□□ -1.476e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 PIP5K1B-204ENST00000440050 813 ntTSL 25.72□□□□□ -1.496e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 PIP5K1B-203ENST00000437200 791 ntTSL 55.67□□□□□ -1.56e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 LUC7L3-210ENST00000507200 510 ntTSL 45.48□□□□□ -1.536e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 SLX4IP-202ENST00000488816 597 ntTSL 55.44□□□□□ -1.546e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.66e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 ZNF451-211ENST00000504603 561 ntTSL 54.09□□□□□ -1.756e-6■■□□□ 12.1
PCBP2Q15366 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.773e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.743e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.643e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.523e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.143e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.453e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.843e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 IGF2BP3-214ENST00000492771 564 ntTSL 412.82□□□□□ -0.366e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 IGF2BP3-209ENST00000474105 663 ntTSL 45.17□□□□□ -1.586e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-7■■□□□ 12
PCBP2Q15366 DNHD1-205ENST00000477562 566 ntTSL 411.55□□□□□ -0.562e-8■■□□□ 12
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 356.7 ms