Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms