Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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