Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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