Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNB1Q14721 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms