Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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ATP1A4Q13733 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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ATP1A4Q13733 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
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ATP1A4Q13733 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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ATP1A4Q13733 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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ATP1A4Q13733 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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ATP1A4Q13733 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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ATP1A4Q13733 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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