Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTCH1Q13635 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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