Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CUL3Q13618 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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