Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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