Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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