Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMD2Q13200 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMD2Q13200 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms