Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM2Q13029 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
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