Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PTPRJQ12913 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PTPRJQ12913 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PTPRJQ12913 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms