Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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