Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXO1Q12778 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXO1Q12778 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXO1Q12778 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXO1Q12778 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXO1Q12778 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXO1Q12778 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXO1Q12778 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXO1Q12778 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXO1Q12778 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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