Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms