Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms