Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PITPNAQ00169 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms