Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms