Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AIF1P55008 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AIF1P55008 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AIF1P55008 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AIF1P55008 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AIF1P55008 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AIF1P55008 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AIF1P55008 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AIF1P55008 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AIF1P55008 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AIF1P55008 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AIF1P55008 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AIF1P55008 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AIF1P55008 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AIF1P55008 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AIF1P55008 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AIF1P55008 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms