Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC5A3P53794 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms