Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms