Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MLH1P40692 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms