Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETFBP38117 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETFBP38117 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETFBP38117 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETFBP38117 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETFBP38117 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETFBP38117 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETFBP38117 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ETFBP38117 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms