Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJC1P36383 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJC1P36383 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJC1P36383 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJC1P36383 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJC1P36383 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJC1P36383 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJC1P36383 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJC1P36383 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJC1P36383 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJC1P36383 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJC1P36383 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJC1P36383 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJC1P36383 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJC1P36383 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms