Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN4AP35499 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN4AP35499 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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