Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA3P32297 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms