Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTPRAP18433 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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