Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms